Mit der Zeile

GPIO.setmode(GPIO.BOARD)

legst du das Pinmapping fest. Entweder du nimmst das Boardlayout, dann ist GPIO 0 Pin 1 und du musst schreiben:

GPIO.setup(3 , GPIO.OUT)
GPIO.output(3 , True)

Oder du nimmst das BCM Layout

GPIO.setmode(GPIO.BCM)

und dann ist GPIO 0 auch GPIO 0:

GPIO.setup(0 , GPIO.OUT)
GPIO.output(0 , True)