Ich hab mir gestern mal so ein Schaltplan von einer A4988-Steckbrücke angeschaut. Da saß ein 100k-Widerstand gegen Masse an /Enabled.
Kann es sein, dass die Versorgungsspannung beim Einschalten sehr langsam steigt und sich die Brücken mehrfach über /Enabled resetten?
(Ein Pullup im Bereich 1k..4k7 wäre dann vielleicht eine Möglichkeit, die Treiber während des Einschaltens etwas stabiler zu deaktivieren)