.. Fuse Bits habe ich außer acht gelassen .. An die IR Schnittstelle ist dann sowieso nicht mehr ranzukommen .. auch ohne den Bootloader zum laufen ..
Grad vor zwei Wochen gabs ähnliche Problemchen, dieses Posting und das folgende (mindestens ab "BTW, kleiner Tipp ..") könnten Dir vielleicht helfen - einmal wie man schnell und mit wenig Aufwand beim asuro zum "üblichen" Flashen beim und zu den Fragen des Bootloaders.

Die fuses sollten folgendermaßen gesetzt werden damit der bootloader
aktiv und die serielle programmierung des megas weiterhin möglich ist:
- high fuse 0xDA
- low fuse 0xBF
- lockbits 0xFF

So - vielleicht hilft Dir das.

Viel Erfolg und Glück