Bei den HW Settings muss er Dir eine Spannung anzeigen. 5V (5,1V sind auch ok) oder 3V je nach dem. Wenn er aber die Signatur korrekt ausliest, sollte da auch ein Spannungswert erscheinen. Ob es nun an der Version liegt kann ich nich genau sagen. Es gab mal mit der Ver 4.13 Probleme bei bestimmten µCs.
4.17 ist die Neue (findest Du hier http://www.atmel.com/dyn/products/to...p?tool_id=2725), und um alles auszuschließen kann man die ruhig mal installieren