29000 ??? Das ist etwas viel für einen 10 bit ADC

1023 ist schon besser,
aber das bedeutet das an ADC0 und ADC1 5 V anliegt...
Hast Du da etwa eine Brücke eingebastelt ?
Selbst wenn die Phototransistoren platt wären dürfte en keine 1023 geben, weil da ein widerstand von 4,7 K gegen VCC liegt.

Mess mal ADC0 und ADC1 gegen VCC hast Du da 4,7k oder 0 ?

oder bin ich da auf dem falschem Weg ?

Gruß Sebastian