Der Grund für das Toggeln der Parallelport Pins liegt vermutlich am BIOS. Das prüft auf die Art, ob an der Adresse ein Parallelportbaustein angeschlossen ist.

Dazu wird ein Wert in die entsprechende Adresse geschrieben und wieder ausgelesen. Wenn der ausgelesene Wert gleich dem geschriebenen ist, ist ein Port(-Baustein) da. Sonst nicht.

Ich vermute, das wird bei neueren Boards auch nicht viel anders sein.

Gruss
Axel