die seriell schnittstelle kannst du nutzen um irgendwelche informationen zwischen pc und AVR auszutauschen.
du könntest irgendwelche Sensoren am AVR anschließen, zb per adc. dann misst der AVR die spannung und schickt sie an den PC, wo sie gespeichert und ausgewertet werden kann. umgekehrt kann man vom PC auch kommandos senden um die ausgänge des avrs zu schlten und so irgenwelche schaltungen/geräte vom PC aus zu steuern.
die schnittstelle lässt sich natürlich auch zum debuggen benutzen indem man zb variablen ausgibt und in welcher programmzeile der controller gerade ungefähr ist...