Wenn Ich richtig lese ist der aber zur Zeit nur mit AVRDUDE kompatibel.
Wenn Du es nicht schon weißt:
Du kannst die Kommandozeile fürs AVRDude in ATMEL/MICROCHIP Studio unter "Tools/External Tools" eintragen:
https://www.mikrocontroller.net/topic/477806#5950668
Das leitet dann auch die Ausgabe von AVRDude ins Output-Fenster im Studio um.

Kompilieren UND Programmieren (ehem. ALT+F5?) auf einen Klick geht damit zwar nicht, aber es kommt schon nahe dran.