aber wenn ich vom port direkt an den clock gehe, tuht er das selbe.und der ausgang vom port ist doch prellfrei oder?
Weist du denn genau, was der Parallelport an die Relaiskarte sendet? Einfach nur 5V/Gnd(hast du das Signal direkt vor dem Relais abgegriffen?)?

PS: Das Relais kannst du im Prinzip mit einem RC-Glied entprellen(Widerstand in Reihe zum Relais und einen Kondensator zwischen Gnd und Clock - gegebenenfalls müsste dein Pullup/Down dann größer sein.). Aber auch dann ist ein Relais zum übertragen des Clock-Signals nicht gerade elegant...