Der LTC4054 hat lt. Datenblatt eine Unterspannungsabschaltung. Der typ. Wert hierfür: 3.8V.
Daher sollte der Step-Up-Wandler 0V bekommen, wenn die Spannung am Eingang des LTC4054 unter 3.8V fällt.
Sinn und Zweck des Undervoltage Lockout ist genau das; der Baustein schaltet das gesamte Gerät ab, wenn die Spannung des Akkus/Batterie zu niedrig ist.

Zur Erklärung von Texas Instruments: https://www.ti.com/lit/an/slva769a/slva769a.pdf

Das Oszi hat vermutlich eine Akkuabschaltung..