Wäre es nicht einfacher, ein Drivermodul einzusetzen, das Microstepping unterstützt?
A4988 oder DRV8825 zum Beispiel oder wenns noch höherer Auflösung bedarf ein TMC21XX/22XX oder ähnliches. Das sollte die Geräuschentwicklung ohne großen Aufwand schon mal deutlich senken.
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