Willst du ein Maussignal einlesen?
Wenn du mit Interrupts arbeitest, dann kannst du doch entscheiden, ob du eine High oder Low-Flanke als Signal haben willst. Um Rauszufinden in welche Richtung es geht, muss du doch nur schauen, ob bei einem Signale auf gerade das andere anliegt oder nicht. Du brauchst also quasi nur einen Interrupt für ein Signal, oder liegt hier jetzt ein Denkfehler vor?
Was meinst du mit Taktreseve, bevor du eine Schatlung baust, wäre es vieleicht sinnvoll, einfach einen weiteren Controller zu nehmen, vielleicht mit internem Takt, dann sparst du dir noch mehr Bauteile und der Controller könnte die ganzen signale schon "Mundgerecht" aufbereiten und über RS232 oder I2C übertragen.

MFG Moritz