Der Spannungsregler kann nicht durch die Motoren zu heiß werden, die Motoren werden über den genannten Jumper direkt mit der Batterie verbunden.
@Chris266: Wenn dein Testprogramm korrekt ist, dann ist vielleicht Motortreiber überlastet. Er hält zwar kurzzeitig bis 1 A aus, aber die Dauerbelastung sollte schon wesentlich niedriger sein (unbedingt unter 600 mA).
Wenn du ihn zu stark belastest dürfte er sehr heiß werden,
hier wäre dann auch ein kleiner IC-Kühlkörper empfehlenswert.

Gruß Frank

PS. Bitte nicht doppelt posten, die meisten lesen sowieso überall. Manchmal kann´s halt mal etwas dauern bis jemand Zeit für eine Antwort findet!