Wenn du LiPo 4S nimmst und dein Netzteil nicht wesentlich mehr als 12V bringt, dann kannst du die Dioden 1 weglassen. Die Dioden 2 sollen vor dem Schaltregler sein. Du brauchst auch nur eine Diode vor dem Schaltregler für Raspi und Arduino. Zwischen Diode und Schaltregler aber einen größeren Elko als Puffer.
Die Schaltregler brauchen an Eingang etwa 2V mehr als am Ausgang eingestellt.
Die Arduino sollten einen 5V Eingang haben.
Der Snubber sollte in der Dimensionierung schon passen. Über den Kondensator fließt kein Gleichstrom.
Das Adafruit Motorshild kenne ich nicht. Die gängigen Schrittmotorsteuerungen haben eine einstellbare Strombegrenzung eingebaut. Da kannst du ohne weiteres mit höherer Spannung die Motoren betreiben und brauchst daher den zweiten Spannungsregler nicht.