Kenne mich zwar mit Arduino nicht aus, aber bei der Verwendung fertiger Bibliotheken schaue ich mir generell die mitgelieferten Beispiele an. In dem Fall springt mir sofort ins Auge, dass in den Arduino-Beispielen hinter Serial.begin() mit
Code:
while (!Serial) {
    ; // wait for serial port to connect. Needed for native USB port only
  }
gewartet wird, dass die Initialisierung der seriellen Schnittstelle fertig ist. Vielleicht hilft das in deinem Fall auch?