Nun wenn der CoController noch zu programmieren ist, dann scheinen die Bascom Einstellungen ja doch zu stimmen.
Und wenn ich es richtig verstanden habe, dann ging anfangs der Hauptcontroller auch zu programmieren. Da das Problem offenbar zeitgleich mit der Brücke zum Servocontroller entstand, ist es duchaus denkbar das da was am Controller im Eimer ist. Eventuell hast du den falschen Pin erwischt oder bist kurz an zwei falsche Kontakte gekommen.

Ich würde diese Servobrücke erst nochmal entfernen und dann nochmal Programmierung checken. Im schlimmsten Fall brauchst du neuen Controller.