Um mit Java was über die serielle Schnittstelle zu machen brauchst Du noch RXTX. Von Hause aus kann Java das nicht.

USB 2 seriell Adapter stellen einfach einen virtuellen seriellen Port zur Verfügung. Musst halt darauf achten, ob deine Hardware wirklich RS232 ist, was bedeuted, dass die Level bei +-12V liegen. Die andere Möglichkeit ist, dass dein Controllerboard TTL Level nutzt (also 5V). Der USB 2 seriell Adapter muss halt dazu passen. Wenn ich mich recht erinnere gibt es auch welche die können beides.