Code:
char str[32];
int i = 0, j = 0;
int val[2];


...


    while(Serial.available() > 0) {
        str[i] = Serial.read();
        
        if(str[i] == '\n' || str[i] == ',') {
            str[i] = '\0';
            i = 0;
			
			val[j] = atoi(str);
			j++;
			
			if(j > 1) {
				j = 0;
				/* flag etc setzen, dass 2 Werte empfangen wurden und verarbeitet werden können ... whatever... */
			}
            break;
        }
        
        i++;
    }


...
mfg