Die Nullinie ist in der Mitte?
Am Anfang sind es 12V, dann kommt ein Abfall auf 5V mit einer Zeitkonstanten von etwa 0,15 Rastern oder 0,2 Periodendauer. Wieviel ist denn ein Raster oder wie groß ist die PWM Frequenz?
Hat die Zeitkonstante etwas mit dem Kondensator hinter dem LM317 zu tun? Kapazität, Strom (oder Widerstand) des Schrittmotors.

Bei der weiteren Analyse des Bildes stört das Raster und die grüne Kurve,
ich glaube im Hintergrund ist jemand mit einer Kamera.
Manfred