Wie Felixx schon richtig gesagt hat, verhindert der Lötstoplack, dass an diesen Stellen die Leiterbahn verzinnt werden kann. Für die Funktion einer Platine ist das irrelevant. Wichtig ist das ganze v.a. in der industriellen Fertigung, da dort die Platinen durch ein Lötbad gezogen werden und somit das Lötzinn überall hängen bleibt, wo freie Leiterbahnen liegen. Mit einer Lötstopmaske sind dann eben nur die Flächen, an denen Pins usw. sind, frei.
Es hat natürlich auch weitere Vorteile, wie z.Bsp Schutz vor Kurzschlüssen bei Verschmutzung etc. ABer für zuhause brauchen tut mans net unbedingt, hauptsache die Leiterbahnen sind verzinnt.