Ich meinte eigentlich das der µC zwischen Empfänger und Motorregler eingepflanzt wird. Der Empfänger und der Motorregler werden dazu natürlich mehr oder weniger getrennt.
Der µC übernimmt jetzt die komplette Steuerung, ob autonom oder manuell ist ab µC egal. Nur die empfangenen Signale vom Empfänger müssen dem µC mitteilen können, was passieren soll.

Umschalten? -wie oben beschrieben, in Software.

Und Thalhammer hat es angesprochen: möglicherweise reicht das nicht aus - Hindernisse müssen ggf auch noch umfahren werden können per zusätzliche Sensoren.

Viele Grüße

EDIT: Wasser? ähnlich Ketten? äh ... naja, ich denke wenn Du weiter so mit Infos um Dich wirfst, wird es schwierig....für Dich