Mit JTAG schauts schlecht aus; JTAG ist auf dem AVR deaktiviert, wird man also von draussen nicht draufkommen.

Was mir noch eingefallen wäre: Könnte HV Prog hier helfen?
Hätte da schon mal geschaut, nur passt die Pinbelegung vom ATMega2560 (Datenblatt) nicht mit der vom Dragon zusammen.
Dragon: Data0-7, CTRL0-7, XTAL, Reset, GND, Vcc.
M2560: PB0-PB7 ist Data. XTAL kommt an XTAL1, Reset/GND/Vcc sind auch klar.
Nur wie sind CTRL0-7 vom Dragon und die anderen genannte Pins vom AVR (RDY, OE, WR, BS1, BS2, XA0, XA1, PAGEL) zu verbinden?

Wenn das gehen würde, müsst ich mir fast mal irgend nen Dragon o.ä. besorgen, der HV Prog kann.