Genau, das ist, glaube ich, die einfachste Lösung.

Aber was wäre mit Tiefendladeschutz, auch ständig die Akkuspannung überwachen und mit extra Schalter den Lipo vorzeitig abschalten ?

Ich kann den µC und z.B. bistabilen Relais als stromsparenden Schalter auch mit kleinem Akku puffern (z.B. Ni-MH Memopuffer 3,6 V).