Wenn du keine Möglichkeit hast das Taktsignal zu überprüfen (Oszilloskop) und auch keine Möglichkeit der HV - Programmierung hast, bleibt dir nur der Vorschlag von Hubert.G. Neuen ATMega besorgen Fusebits nicht anrühren und erst mal mit internem Oszillator versuchen den Programmcode zu brennen.
Im übrigen kannst du das Taktsignal auch Testweise mal mit einem 555 erzeugen, wenn du hast. So könnte man einen Fehler beim Quarzoszillator feststellen, wenn die Fuses dafür auch gesetzt sind.