Hast du in den WLAN Einstellungen "Enable CMD Mode by GPIO" aktiviert?
Einfach mal auf den Button klicken.

Ausserdem musst Du die Flusskontrolle aktivieren - wie weiter oben schon gesagt, wird das bei dem Initial Config Script deaktiviert und erst mit "Run default WIFI config!" wieder aktiviert.
Oder indem man in der WLAN Kommandozeile einfach
set UART flow 1
save
reboot

ausführt.

MfG,
SlyD