Warum verwendest du dann nicht die funktionierende Schaltung für deine Modifikation. Alle Änderungen passieren doch hinter dem Ausgang deines FF, da wo jetzt die LED sitzt. Dann brauchst du nicht an verschiedenen Ecken Fehler zu suchen.
Davon abgesehen, poste deinen momentanen Schaltplan mit Bauelemententyp und Wert. Was für eine Betriebsspannung verwendest du und woher kommt sie (Netzteil, Batterie). Über was für Messmittel verfügst du?