Danke für die kompetente Hilfe, aber es funktioniert immer noch nicht.

"Port_DataDirBit(PWM_IR,PORT_OUT)"

hatte ich auch schonmal, aber hatte sich leider nichts verändert.
Ich werd die Frequenz mal mit nem Oszi testen lassen.
Ich hab nochmal Spannungen gemessen:
OC3A zu Masse sind etwa 2,5V, PD5 zu Masse 5V.
Bleiben also für die 3 LEDs und den Widerstand etwa 2,5V

Gruß