Hast du hinter dem Treiber direkt die Motoren und sind da Freilaufdioden dran? Weil das mit der Drehrichtungsumkehr hört sich nach fehlen dieser Dioden an. Du musst Transistoren (und in deinem Treiber sind welche drin) bei Relais, Schützen und Motoren immer mit Freilaufdioden gegen die Eigeninduktion der Spulen absichern.