Kommt darauf an, welchen Programmer Du hast.
Ich weiß nicht, ob das Studio 5 mit Atmel-fremden Programmern zurecht kommt.
Klick mal bei angeschlossenem Programmer im Menü auf Tools -> AVR Programming
Wenn oben links in der DropDown Box nur "AVR Simulator" auftaucht, gehts leider nicht.

Gruß,
askazo