Die Nennspannung der LiFePo Zellen liegt bei 3.3V pro Zelle (also 13.2V für 4 Zellen). Die Ladeschlusspannung liegt aber bei 3.6V pro Zelle ( => 14.4V insgesamt). Beim Entladen sinkt die Spannung jedoch sehr schnell auf unter 3.5V pro Zelle ( => 14.0 Volt). Probiere doch mal aus, welche Leerlaufspannung die Akkus nach dem Laden tatsächlich haben. Vielleicht reicht es ja, während dem Laden den Akku vom Motorcontroller zu trennen.

Du kannst auch einfach beim Hersteller des MD25 fragen, ob die Verwendung von 4 LiFePo-Zellen mit einer Maximalspannung (Ladeschlusspannung) von 14.4 Volt noch ok ist.

Als Notlösung könnte man die Spannung auch durch eine in Serie geschaltete Diode (Strombelastbarkeit beachten) auf unter 14V reduzieren.