Also dann ist die Sache wohl klar:
ohne Freilaufdioden hast Du immense Überspannungspikes an den Motoren aufgrund der induktiven Last, die beim Abschalten den Strom weiter führen will.

Normale pn-Diode gehen auch als Freilauf, es müssen keine Schottky-Dioden sein. Dein Schaltbild ist o.k.