Hinter den Gleichrichter (nicht Wechselrichter!) solltest Du noch einen dicken Elko zur Glättung einbauen. Die Größe ist davon abhängig, was Du an der 12V-Leitung noch betreiben möchtest. In der Regel sagt man 1000µF pro Ampere, weniger als 470µF würde ich da aber auf jeden Fall nicht nehmen.

Zudem solltest Du noch Abblockkondensatoren am ATMega vorsehen.

Gruß,
askazo