Wo der Pullup-Widestand ist, ist nicht so wichtig. Dicht am µC hat aber einen kleinen Vorteil, wenn größere Störungen über die GND leitung kommen. Der Kondensator sollte besser dicht an den µC.

Wie schnell muß den reagiert werden ?

Eine bessere Abschirmung oder Masseführung ist natürlich auch eine Option.