Die PWM Betriebsmodi basieren nicht auf Interrupts. Wenn der Timer einen Takt hat, dann wird das PWM Timing vollständig von der Hardware erzeugt. Du stellst Betriebsmodi und Takt ein, und genau in diesem Moment rennt die PWM los. Willst du das nicht, muss du die CS Bits auf Null lassen, dann steht der Timer, und somit gibts auch keine PWM am Pin


Edit: Die ISR stand aber eben noch nicht im Code oder!? Ich glaube jetzt ist mir eher klar was du meinst. Du erwartest wegen OCR0 = 0; dauerhaft Low am Ausgang, oder? Sollte eigentlich auch so sein Bist du sicher das kein Interrupt auftritt? Was passiert ohne die ISR im Code? Wie erwartet Low am Pin?