Ja mit dem Clear down und Clear up legst du fest, wann der Controller schaltet.
Wenn du Comparea = 50 und Clear up eingestellt hast zählt der Controller von 0-255 und schaltet dann bei 50. Wenn du Clear down eingestellt hast zählt der Controller von 255 runter und schaltet dann bei 50. Und dadurch ergeben sich zwei verschiedene Tastverhältnisse. So kannst du auch deinen Gegentakt PWM erzeugen, indem du Compare A = Clear up und Compare B = Clear down schreibst.