Ich würde mal ganz stark vermuten das das eventuell mit dem Ladevorgang des Kondensators zusammen hängt..... . So wie das im Plan gezeichnet ist wird der Kondensator direkt an 5V geklemmt, wenn man den Schalter betätigt. Ein entladener Kondensator wirkt im Einschaltmoment wie ein Kurzschluss. Dadurch passiert es dann das die Spannung zusammenbricht und der Mega verrückt spielt.
Das wäre eine Vermutung von mir....