Wenn du den Controller flashen willst, klickst du ja auf das schwarze IC wo "AVR" draufsteht. Dann öffnet sich ein Fenster und in diesem Fenster klickst du auf "Fuses".
So und da gehst du auf SUT_CHSEL und wenn du jetzt ein Quarz mit mehr als 10MHz (bei dem Wert bin ich mir nicht sicher!) stellst du das auf "Ext. Crystal/Resonator High Freq.; Start-up Time 16K: CK +64ms". Wenn dein Quarz unter 10MHz ist stellste das Bit auf Medium bzw Low Freq.
Bei den setzen der Fuses aber ganz vorsichtig sein und KEINE Fuses setzen von denen du nicht weißt was die machen. Weil dadurch kannste dir den ISP abschalten und dann geht nur noch JTAG.
Und falls du den falschen Clock gesetzt haben solltest einfach mit einem Frequenzgenerator oder einer anderen Taktquelle ein Quarz "simulieren"