Wenn du eh schon einen microcontroller nutzt, dann mache es doch gleich digital: Der Controller misst per ADC die Spannung jeder einzelnen Zelle (über den Balancerstecker des Lipos verbunden). Hat eine Zelle eine höhere Spannung als die anderen, dann schaltet der controller einen Transistor, so dass die Zelle mit der zu hohen Spannung 20 mA z.B. an eine LED abgibt... Könnte doch gehen...
Es sei denn, du sprichst die ganze Zeit von einer anderen Art balancer als ich sie kenne. Meine Balancer funktioneiren so: Vor dem Laden an den Lipo anstecken, jetzt werden die einzelnen Zellen auf die gleiche Spannung gebracht (zellen mit zu hoher Spannung werden entladen). Danach Balancer abstecken und Lipo normal laden.