Könnte es sein, dass Dein Programm zur Linienverfolgung die gespeicherten Werte für die Sensoren überschreibt?
Ich meine jetzt nicht beim Aufspielen sondern bei der Ausführung.
Das Du eventuell unbeabsichtigt Werte dort ablegst wo die Kalibrierungswerte stehen.

Das erklärt zwar nicht das blinken aber es wäre eine Möglichkeit.

Hast Du die Sensoren mal auf funktionstüchtigkeit hin überprüft?
Ich könnte mir vorstellen das ein Defekt an der Stelle zu einem derartigen Verhalten führen könnte.

MfG JoeBlack