Du kannst um JTAG nur temporär zu deaktivieren (falls du dich mit den Fuses noch nicht so auskennst) ganz am Anfang deines Programms zweimal hintereinander das Bit JTD im MCUCSR Register setzen (das funktioniert aber nur, wenn das Bit innerhalb von 4 Takten zweimal gesetzt wird, also wenn du in der Zwischenzeit nichts anderes machst).