Nutzt jemand den Atmega32 erfolgreich mit externem Quarz und schreibt seine Fuses mit AVR Studio?
Ja, mach ich und hatte eigentlich noch keine Probleme damit.
Ich nutze sehr oft externe 8MHz Quarze am ATMEGA 16 und 32.
Auch mit einem 16MHz Quarz hat bei mir bis jetzt immer alles geklappt.

Ich nutze dabei die Einstellung:
Ext. Crystal/Resonator High Freq.; Start-up time: 16K CK + 64 ms

Ich hab die AVR Studio Version 4.17 Built 666 und den AVR ISP MKII als Programmer.
Du hast aber schon die Fuses richtig gesetzt bevor Du das .elf File abgespeichert hast ?