Das mit der Lib meinte ich eigentlich nicht, ich wusste auch gar nicht das es solche Jumper in den Eagle Libs gibt....man lernt halt nie aus.....
Worin besteht denn das Problem die Leitung nicht in den Toplayer zu verlegen? Wie du die Verbindung letztenendes herstellst bleibt ja nach wie vor dir überlassen.
Eine andere Möglichkeit wäre noch die Massepunkte unterschiedlich mit Supply Symbolen zu benenne, z.b mit 1x 0V und 1x Gnd ex oder so, also so verfahren als ob man unterscheidliche Masepotentiale verwenden würde. Habe ich bei einigen Schaltungen von mir auch schon so gemacht.