Die Stromversorgung würde ich anders gestalten.
C1 vor die Diode, ich nehme mal an es kommt DC, und L1 ebenfalls vor die Diode.
Wenn der Motor kurz mehr Strom braucht, bleibt dem Kontroller noch das was in den Elko steckt.
In deinem Fall würde auch C3 über den Regler zurück entladen, was diesen zerstören könnte. Es sollte dann zumindest eine Diode in Sperrrichtung über den Regler gelegt werden.