Ich weiß zwar nicht, ob du das schon versucht hast. Öffne den Dialog, in dem du die Fuses ändern und Programme flashen kannst. Im Reiter Main sollte der richtige µC ausgewählt sein. Du könntest versuchen mit "Read Signature" die Signatur auszulesen. Die ISP Frequenz kann man auslesen (Button Settings und dann auf Read).
Beim Reiter "HW Settings" kannst du die Spannungen auslesen (Versorgung und Aref).

Ich habe gerade den gleichen Fehler, bei mir ist aber das Board mit dem Atmega ausgeschalten.

MfG Hannes