Die Fototransistoren kommen normalerweise zwischen den +5 V und einen AD Eingang. Dazu kommt dann ein Widerstand von ca. 10-100 kOhm von dem Eingang nach GND. Wie groß der Widerstand werden muß hängt von der LED, dem LEDstrom und der Ausrichtung ab. Bei einem weissen Papier sollte hier ein Spannung von etwa 2 V erreicht werden. Dann kann man den AD Wandler gut mit 2,5 V als Ref. Arbeiten. Beim Mega88 sollte die Spannung entsprechend niedriger sein.

Den ADC ließt man aus mit Getadc(kanal).