Hallo,
ich habe mir dazu einen Timer gemacht, der im 1/1000s Takt überläuft.
So kannst du mit ms-Auflösung arbeiten.
Der DS1307 kann ja nur Sekunden zählen und ich sehe da keine einfache Möglichkeit, ihm ms beizubringen. Ich kenne auch sonst keine RTC die das kann.
Bei deiner Anwendung wird aber eh nicht das Problem sein, über Tage mit geringer Abweichung die Zeit zu bekommen, sondern eher, relativ kurze Zeiträume im Sekunden- oder Minutenbereich.