klingt so, als würdest du für linux compilieren und nicht für avr; auf einem 32bit-debian ist stubs-32.h jedenfalls im paket "libc6-dev".

evtl mußt du ja irgendwo bei den compiler-settings anstatt "gcc" den "avr-gcc" auswählen.

das wär jedenfalls mein schuß ins blaue als debian- und emacs-user.

cm.