Wenn es vom Hyperterminal aus geht, zwischen den µC aber nicht, dann würde ich mal auf einen Unterschied zwischen den CR/New_Line Zeichen tippen.
Lass dir doch mal die Länge des Strings ausgeben, bevor der Split Befehl es zerstückelt, und danach die Längen der einzelnen Stücke.
Evtl. kannst du auch die ASCII Werte aller Zeichen ausgeben.
Wenn dann irgendwo noch der Wert 10 oder 13 auftaucht, dann ist das der Grund für den Fehler.

Gruß

Rolf