C-Control ohne Windows könnte ein echtes Problem sein. Denn ich glaube nicht, das man den speziellen "Compiler" unter Linux laufen lassen kann.
Man könnte matürlich auch den µC direkt programmieren, aber dann braucht man eingentlich kein C-controll mehr, sondern kann einen unprogramierten AVR Controller nehmen. Es macht kaum Sinn extra Geld für einen mit speziellem Porgramm zu bezahlen, das man dann ohnehin löscht.