@Lurchi du hast völlig recht, nun führe dir aber nochmal die funktionsweise einer festplatte vor augen! eine sich drehende platte, auf der IRGENDWO ein tastkopf schwebt ... fang ich an zu schreiben, platziert er n fetzen hier, n fetzen da usw. ein flash speicher, sofern darauf die dateien nicht allzu wüst zerstückelt werden, schreibt von haus aus immer sequentiell ein byte nach dem anderen .... wenn ich jetzt auf einer 5MB Karte(hypothetisch) 5 mal 1 byte dateien schreibe, die dann jede 2te datei lösche und dann eine 2mb datei schreibe, wird sie fragmentiert.
solange die karte immer schön gelöscht wird bevor drauf geschrieben wird, gibts da kein problem ... so hab ichs zumindest aus eigener erfahrung gelernt ... (vor längerer zeit)

ich würde trotzdem einfach die datei per kabel zur maschiene übertragen und die flashcard nur als speicher verwenden oder eben nen EEPROM chip nehmen, aber wo bleibt dann die herausforderung ^^